Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NsmfQ99NF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NsmfQ99NF2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms