Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brms1Q99N20 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1Q99N20 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms