Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col25a1Q99MQ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1442.2 ms