Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nus1Q99LJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nus1Q99LJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms