Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan1Q99J59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan1Q99J59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms