Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl1Q99J56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl1Q99J56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Derl1Q99J56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Derl1Q99J56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Derl1Q99J56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms