Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln1Q99J21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln1Q99J21 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms