Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfdQ925I7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfdQ925I7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PdgfdQ925I7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PdgfdQ925I7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PdgfdQ925I7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfdQ925I7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfdQ925I7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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