Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim7Q923T7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim7Q923T7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms