Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3bQ91ZU9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3bQ91ZU9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3bQ91ZU9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms