Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha11Q91Y19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha11Q91Y19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms