Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prb1Q91X93 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prb1Q91X93 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms