Protein–RNA interactions for Protein: Q91WR6

Ginm1, Glycoprotein integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ginm1Q91WR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ginm1Q91WR6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ginm1Q91WR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ginm1Q91WR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms