Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csde1Q91W50 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csde1Q91W50 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms