Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx9Q91VH2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx9Q91VH2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms