Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsx1Q91V10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsx1Q91V10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx1Q91V10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx1Q91V10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms