Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TraipQ8VIG6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TraipQ8VIG6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms