Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nle1Q8VEJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nle1Q8VEJ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms