Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc18Q8VD24 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc18Q8VD24 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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