Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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