Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnaaf4Q8R368 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnaaf4Q8R368 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnaaf4Q8R368 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnaaf4Q8R368 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms