Protein–RNA interactions for Protein: Q8R265

Vmn1r197, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r197Q8R265 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r197Q8R265 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r197Q8R265 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r197Q8R265 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms