Protein–RNA interactions for Protein: Q8R149

Bud13, BUD13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud13Q8R149 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bud13Q8R149 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bud13Q8R149 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bud13Q8R149 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bud13Q8R149 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms