Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

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Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpv3Q8K424 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpv3Q8K424 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv3Q8K424 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv3Q8K424 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv3Q8K424 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv3Q8K424 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv3Q8K424 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv3Q8K424 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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