Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip2Q8K221 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arfip2Q8K221 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms