Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Polr1eQ8K202 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1eQ8K202 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms