Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek9Q8K1R7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nek9Q8K1R7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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