Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q4Q8HWB2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2-Q4Q8HWB2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q4Q8HWB2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms