Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rab11fip3Q8CHD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab11fip3Q8CHD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rab11fip3Q8CHD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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