Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rp1l1Q8CGM2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1l1Q8CGM2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms