Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brf1Q8CFK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brf1Q8CFK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brf1Q8CFK2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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