Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9030612E09RikQ8CE20 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9030612E09RikQ8CE20 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9030612E09RikQ8CE20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
9030612E09RikQ8CE20 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
9030612E09RikQ8CE20 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms