Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc38Q8CDN8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc38Q8CDN8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms