Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Riox2Q8CD15 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Riox2Q8CD15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riox2Q8CD15 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riox2Q8CD15 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms