Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcas3Q8CCN5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcas3Q8CCN5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas3Q8CCN5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms