Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RybpQ8CCI5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RybpQ8CCI5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RybpQ8CCI5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms