Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn3Q8CBC6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrn3Q8CBC6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrn3Q8CBC6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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