Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc186Q8C9S4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc186Q8C9S4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms