Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms