Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4bp3Q8C7U1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp3Q8C7U1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
N4bp3Q8C7U1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms