Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx6Q8C7R7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Rfx6Q8C7R7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx6Q8C7R7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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