Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4H2

Samd3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd3Q8C4H2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd3Q8C4H2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd3Q8C4H2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd3Q8C4H2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms