Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp37Q8C0R0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp37Q8C0R0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp37Q8C0R0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms