Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg16l1Q8C0J2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg16l1Q8C0J2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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