Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccser1Q8C0C4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccser1Q8C0C4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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