Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc122Q8BVN0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc122Q8BVN0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc122Q8BVN0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc122Q8BVN0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms