Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig4Q8BTF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig4Q8BTF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig4Q8BTF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms