Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pbrm1Q8BSQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pbrm1Q8BSQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pbrm1Q8BSQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms