Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd4Q8BSD4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd4Q8BSD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjd4Q8BSD4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.6 ms