Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abraxas1Q8BPZ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abraxas1Q8BPZ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms